Plateforme d’imagerie par microscopie - PIM

La PIM est une plateforme de l’institut de la Mer de Villefranche/Mer, et met au service de ses utilisateurs différentes technique de microscopie. 

Outre l’accès à des microscopes commerciaux modernes, la PIM développe également des algorithmes d’analyse d’images sur mesure en collaboration avec l’utilisateur mais aussi du prototypage.

La PIM fait partie de la plateforme régionale MICA (Microscopie Imagerie Cytométrie Azur) labellisée IBiSA et membre d’EMBRC-France (European Marine Biological Ressource Center),qui propose des services d’accès et d’études des environnements côtiers.

Microscopes en accès :

• Microscope confocal : Leica Stellaris 5 (laser blanc)
• Microscope confocal : Leica SP8
• Feuillet de lumière : Viventis LS2 + ORCA Fusion
• Épifluorescence motorisé : Zeiss Observer + Flash4.0 (Zen)
• Épifluorescence motorisé : Zeiss Axiovert200M + ORCA Fusion (Metamorph)
• Microscope électronique à balayage : Hitashi 4000+
• Épifluorescence manuels : Olympus BX51 + Axiocam 305C (Zen)
• Épifluorescence manuels : Zeiss Imager A2 + Axiocam 506C (Zen)
• Stéréomicroscope: Zeiss Stemi 508 + Axiocam 305C (Zen)
• Stéréomicroscope: Leica M205FA + MC170 HD (LAS)

Expertise logiciels :

• Analyse d’images : ImageJ, Imaris, Matlab, HRM
• Prototypage : Labview, Arduino IDE, FreeCAD, MIT App Inventor

• Étudier vos besoins et effectuer l’analyse de faisabilité et le développement méthodologique.
• Assurer la formation à l’utilisation des microscopes et aux logiciels d’acquisitions d’images. 
• Assurer une assistance à l’utilisation des logiciels d’analyses d’images. 
• Assurer la gestion des données images avec notre base de données images Omero
• Garantir la confidentialité des données.

Types de microscopie :

• Optique à transmission (brightfield, darkfield, polarization, DIC)
• Épifluorescence,
• Confocal,
• Feuillet de lumière,
• Microscopie électronique à transmission environnementale

Analyse d’image :

• Développement sur mesure d’outils de quantification 2D,3D,2D+t

Gestion de données :

• Formation et mise à disposition d’espace de stockage en ligne via Omero

Si la plateforme est optimisée pour l’études d’organisme marins, elle est ouverte à l’ensemble des structures publiques et privées sans aucune condition thématique, institutionnelle ou géographique.