Géo-microbiologie expérimentale - GEMME

La plateforme de géo-microbiologie expérimentale permet une étude interdisciplinaire des microorganismes et des mécanismes biologiques impliqués dans les biominéralisations et les processus géochimiques (précipitation de carbonates, réactions redox du Fe, S, N, etc.). La plateforme regroupe les appareils nécessaires pour cultiver et étudier des microorganismes aérobies et anaérobies depuis la préparation de milieux stériles, jusqu’à l’incubation des cultures, leur manipulation et leur observation, en passant par le stockage de souches et la possibilité d’analyser les acteurs moléculaires (acides nucléiques et protéines) grâce à des techniques de biologie moléculaire ou de biochimie permettant de mieux comprendre les processus d’intérêt géologique étudiés.

Les 2 membres de la plateforme possèdent une expertise dans les domaines de la microbiologie, la biochimie, la géochimie et la biophysique. Ce savoir-faire est ici appliqué essentiellement pour des thématiques de Sciences de la Terre. La plateforme a été sollicitée pour des projets d’ampleur nationaux et internationaux (ERC, ANR, EC2Co, Interrvie..) visant l’étude du rôle des microorganismes dans les cycles globaux du carbone, du phosphate, du soufre, de l’azote et du fer ainsi que pour développer des procédés de bioremédiation, par exemple. 

• Étudier vos besoins et effectuer l’analyse de faisabilité et le développement méthodologique : Le comité scientifique de la plateforme étudiera toute demande. Suivant la nature du projet, le ou les instruments à mobiliser et l’autonomie du demandeur, l’accès aux instruments et la sollicitation des membres de la plateforme seront évalués et un devis sera proposé. 
• Assurer la formation aux techniques utilisées par la plateforme : Une formation sur les instruments et la signature de la charte des utilisateurs seront obligatoires
• Produire les résultats:  des données brutes à leur traitement et interprétation pour des rapports finalisés
• Confidentialité des données et des résultats

• Préparation de milieux : Systèmes de production Eau ultrapure (18mΩ), autoclaves (capacité jusqu’à 30 litres), laveur de laboratoire
• Cultures des microorganismes : incubateurs, agitateurs thermostatés, bioreacteur de 2L, rampe de filtration, rampe de dégazage pour les cultures anaérobies
• Stockages : chambre froide, congélateurs -20°C et -80°C
• Préparation d’échantillons : hottes à flux laminaire, centrifugeuses, ultramicrotome et contournement de point critique
• Imagerie : microscope optique à épifluorescence
• Analyses Biomolécules : spectrophotomètre (Nanodrop), fluorimètre (Qubit), appareil PCR, appareils d’électrophorèse pour acides nucléiques et protéines, système de chromatographie FPLC, Diffusion dynamique de la lumière (DLS)

Ouvert aux établissements privés ou publics / Devis sur demande.