Plateforme de post-génomique de la Pitié-Salpêtrière

Installée dans les locaux de la Faculté de médecine de Sorbonne Université, la plateforme P3S, certifiée ISO 9001 et NFX 50-900, met à disposition des laboratoires académiques et privés une expertise et des technologies de pointe en matière de génomique et protéomique. Dans le cadre de collaborations, elle propose à ses utilisateurs un accompagnement tout au long de la réalisation de leurs projets, depuis le conseil méthodologique jusqu'à l’interprétation des résultats. La plateforme met également à disposition, au sein d’un service commun, des équipements courants de laboratoires : Q-PCR, scanners et caméra, spectrophotomètres, automate de pipetage…

L’accès libre à ces équipements est conditionné à une formation préalable. La réservation se fait via l'utilisation du portail Open IRIS.

Expertise :

Analyse génomique :

• Génotypage par puces Illumina
• Analyse de la méthylations d’échantillons congelés ou FFPE sur puces EPIC Illumina
• Séquençage de lectures longues par la technologie d’Oxford Nanopore (ONT)

Analyse protéomique :

• Identification et caractérisation de protéines
• Quantification relative par LC-MS/MS et analyse différentielle
• Recherche de partenaires protéiques
• Analyse de modifications post-traductionnelles
• Quantification ciblée absolue
• Électrophorèse bidimensionnelle 2D-DIGE

La plateforme P3S est ouverte aux chercheurs académiques et industriels. Vous pouvez soumettre une demande par courriel pour décrire votre projet. La plateforme reviendra vers vous pour discuter de sa faisabilité, son coût et son délai d’exécution.

Les projets confiés à la plateforme P3S sont réalisés sous la forme d’une collaboration scientifique entre l’équipe de P3S et l’équipe demandeuse. Dans le cadre de cette collaboration, le personnel de P3S s’engage à accompagner l’utilisateur tout au long de la réalisation de la prestation, depuis le design expérimental, pour des conseils et protocoles pour la préparation des échantillons, au cours de l’exécution du projet, dans l’analyse des résultats, le dépôt dans des banques de données si nécessaire et jusqu’à la participation à la rédaction de la publication présentant les résultats obtenus. L’équipe de P3S s’engage par ailleurs à tenir informé l’utilisateur du déroulement du projet, et à lui communiquer toute modification apportée au protocole initialement prévu.

Les deux pôles, génomique et protéomique, proposent des activités de recherche et développement pour s’adapter à vos besoins particuliers. 

Moyen et équipements

Analyse génomique :

• Plateforme BeadStation 500 (Illumina)
• Séquenceur MinION (ONT)
• Séquenceur PromethION-24 (ONT)

Analyse protéomique :

• Système LC-MS/MS : nanoHPLC nanoElute2 (Bruker) et spectromètre de masse timsTOF HT (Bruker) équipé de la technologie PASEF et de la mobilité ionique
• Robot de préparation des échantillons Digest PRO MSI (Intavis/CEM) pour la digestion protéique et le dessalage de peptides
• Équipement complet pour l’électrophorèse 2D-DIGE (GE Healthcare)

Ouvert aux établissements privés ou publics / Devis sur demande .