Plateforme de génomique - Genomer
  • Station biologique de Roscoff

Plateforme de génomique - Genomer

  • Séquençage NGS

La plateforme Genomer de la station biologique de Roscoff, propose la réalisation et l'accompagnement de projets de séquençage NGS – New Generation Sequencing

Présentation

  • Une plateforme labellisée de Sorbonne Université et qui appartient à l’Infrastructure de Recherche EMBRC-Fr. Plateforme labellisée IBISA
  • Un panel complet d’équipements pour la préparation des échantillons : robot Hamilton, Labchip GXT, Bioanalyzer, Covaris, Lightcycler480, Pippinprep, Qubit…
  • Un parc d’instrumentation pour le séquençage NGS -New Generation Sequencing: MiSeq-Illumina, MinIon-Nanopore 

Expertise

Les missions de la Genomer sont de :

  • mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : Mise A Disposition d’équipements-MAD
  • proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de vos projets de recherche : Conduite de Projet en Génomique-CPG 
  • Étudier les besoins, conseiller sur le choix de la méthode, effectuer l’analyse ou le développement méthodologique si nécessaire
  • Dans le cadre de la mise à disposition d’équipement, assurer la formation et l’accompagnement des utilisateurs
  • Produire les résultats sur mesure :  des données brutes à leur traitement et interprétation pour des rapports finalisés
  • Garantir la confidentialité des données et des résultats.
  • Préparation de librairies et séquençage sur Séquenceur MiSeq-Illumina
  • Séquençage de génomes bactériens, Amplicons, banques prêtes à séquencer
  • Développement séquençage 3e génération
  • Analyse de la communauté bactérienne associée aux tissus de l'algue brune Laminaria hyperborea en cours de dégradation - échantillons ADNr 16S
  • Projet ALGOLIFE: Etude du microbiote intestinal de poulet de chair suite à l'administration d'additif à base d'algue - échantillons ADNr 16S
  • Identification bactériennes en symbiose avec les frénulés : espèces de vers marins dans 2 zones de la mer de Barents - génomes bactériens

Ouvert aux établissements privés ou publics / Devis sur demande.
 

Responsable

Gwenn Tanguy

Station Biologique de Roscoff, Place Georges Teissier
29680
Roscoff
Sorbonne Université - Faculté des Sciences et Ingénierie
Station biologique de Roscoff (SBR)
Place Georges Tessier, 29680 Roscoff
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